Вы вновь берете на себя роль Гордона Фримена — ученого-исследователя, оказавшегося на заполненной чужаками Земле, на которой ресурсы стремительно истощаются, а население вымирает. Главному герою придется спасти человечество от зла, которое он же освободил в Black Mesa. Очень много дорогих ему людей надеются на него.
