Представьте себе, что однажды вы просыпаетесь на незнакомом острове, где на каждом шагу вас ждут разнообразные головоломки и загадки. Вы не помните, кто вы есть на самом деле, поэтому единственный выход - начать изучать окружающий вас игровой мир и разгадывать сложнейшие задачи, что, быть может, натолкнет вас на какие-либо воспоминания.
Игрушка имеет открытый мир в виде уединенного островка посреди бескрайнего океана. По ходу игры игроку постоянно придется разгадывать головоломки (их в The Witness порядка 650-ти). Какой-либо захватывающей истории игра не предполагает, но каждая из представленных задачек имеет свою мысль, да и вообще вся игра наполнена своим определенным смыслом.